Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm933J3QPC1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms