Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim18J3QNP2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms