Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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