Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms