Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M1F7CXU4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms