Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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