Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col22a1E9Q7P1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms