Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Krt78E9Q0F0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Krt78E9Q0F0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Krt78E9Q0F0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Krt78E9Q0F0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Krt78E9Q0F0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Krt78E9Q0F0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Krt78E9Q0F0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt78E9Q0F0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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