Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5930D3Z257 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms