Protein–RNA interactions for Protein: D2EAC2

Zbed6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed6D2EAC2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed6D2EAC2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed6D2EAC2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms