Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf11bB4XVQ1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf11bB4XVQ1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Phf11bB4XVQ1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms