Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms