Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Clrn2B2RVW2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Clrn2B2RVW2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clrn2B2RVW2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Clrn2B2RVW2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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