Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms