Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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