Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms