Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttll9A2APC3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms