Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms