Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms