Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms