Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb4A2A863 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms