Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms