Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms