Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm17190V9GX38 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm17190V9GX38 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm17190V9GX38 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm17190V9GX38 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm17190V9GX38 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm17190V9GX38 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17190V9GX38 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17190V9GX38 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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