Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms