Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms