Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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