Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms