Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc6Q9R087 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms