Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms