Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Limd1Q9QXD8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Limd1Q9QXD8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Limd1Q9QXD8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Limd1Q9QXD8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Limd1Q9QXD8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Limd1Q9QXD8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Limd1Q9QXD8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Limd1Q9QXD8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Limd1Q9QXD8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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