Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chaf1aQ9QWF0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms