Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms