Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gde1Q9JL56 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gde1Q9JL56 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gde1Q9JL56 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gde1Q9JL56 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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