Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Habp4Q9JKS5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Habp4Q9JKS5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms