Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Trem1Q9JKE2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trem1Q9JKE2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trem1Q9JKE2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trem1Q9JKE2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms