Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra4Q9JJT2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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