Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms