Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ube3bQ9ES34 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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