Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms