Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Xab2Q9DCD2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms