Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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