Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms