Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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