Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmco5aQ9D9D5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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