Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Z6

Atg101, Autophagy-related protein 101, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg101Q9D8Z6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg101Q9D8Z6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms