Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4bQ9D8B3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms