Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn22Q9D7U6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn22Q9D7U6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms