Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms