Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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